数学科学学院的前身是牡丹江师范学院数学系，始建于1970年。2016年1月成立数学科学学院，学院下设数学与应用数学系、信息与计算科学系、金融数学系和大学数学教学部四个本科教学单位以及调和分析研究所、应用数学研究所两个科研机构。

学院现有数学与应用数学、金融数学、信息与计算科学专业三个本科专业，其中数学与应用数学专业是省级一流建设专业，信息与计算科学专业是校重点建设专业，金融数学专业是交叉学科的特色专业。2016年开始招收学科教学（数学）领域教育硕士研究生。2017年获批数学一级学科硕士学位授权点，面向基础数学、应用数学、数学教育3个二级学科已招生培养。现有本科在校生684人，硕士研究生44人。

学院师资力量较为雄厚。学院现有教职工41人，其中专任教师37人。专任教师中教授7人、副教授13人， 具有博士学位的教师9人、硕士学位的教师26人，在读博士3人。学院现有硕士研究生导师19人，专业硕士研究生校外导师17人。学院外聘专家1人（博士生导师）。 现有省级师德先进个人2人，省优秀教师1人， 校教学名师2人，教学标兵2人，教学能手2人；现有2个校级教学团队，4个院级教学团队；1个校级科研团队，4个院级科研团队。市级学科带头人及后备带头人3人，入选学校优秀青年骨干教师培养计划2人；获黑龙江省属本科高校战略后备人才出国研修计划1人。

学院教研和科研氛围浓厚。近年来，学院教师主持参与省校教育教学改革项目30余项，获省校教学成果奖5项；主持参与国家自然科学基金9项、省自然科学基金4项、厅局级项目40余项。2019年以来，获批中央支持地方高校改革发展资金人才培养支持计划项目2项。在国内外重要学术刊物上发表论文200余篇，其中SCI、EI等检索收录50余篇。出版教材和著作20余部。承办国内外教科研学术会议8场次。通过教师为学生做学术报告，教学内容融入学科前沿成果、引导学生参与科研项目，指导学生创新训练等方式实现科研反哺教学，并取得良好育人成效。

在学生培养过程中，学院努力培育以人才培养为中心的质量文化，深化教育教学改革。坚持以学生为中心，产出为导向，持续改进的教育理念，设计人才培养方案并进行教育教学实施，注重学生综合素质的养成教育。学院实施“职业信念+专业知识+教学技能+创新意识+人文情怀”的五位一体师范生培养模式；构建培养过程注重“夯实学科基础，重实践能力，重创新意识”，培养效果达成“学科素养好、实践能力强、创新精神佳”的“一实两重、三位一体”的非师应用型人才培养模式；开展富有特色的暑期“三下乡”社会实践，“筑梦1+1”公益家教、顶岗支教、金融实习、信息技术实训等团学和实践活动，使得学生在校期间创新能力和专业实践能力得到了大幅提升，学科竞赛成绩喜人，近五年共计获国家级学科竞赛奖40余项，省级奖项210余项。