数学科学学院的前身是牡丹江师范学院数学系，始建于1970年。学院下设数学与应用数学系、信息与计算科学系、金融数学系和公共数学教学部四个本科教学单位以及调和分析研究所、应用数学研究所两个科研机构。学院现有在校本科生和研究生共计950人，教职工50人，专任教师41人。

学院现有数学与应用数学、金融数学、信息与计算科学专业三个本科专业，其中数学与应用数学专业是国家级一流建设专业建设点，2022年通过教育部师范类专业二级认证；信息与计算科学专业是校重点建设专业；金融数学专业是交叉学科的特色专业。2016年开始招收学科教学（数学）领域教育硕士研究生。2017年获批数学一级学科硕士学位授权点，面向基础数学、应用数学、数学教育3个二级学科已招生培养。

学院广大教师深耕教学、潜心科研。五年来，学院教师获批省级科研、教学改革项目12项，获批中央支持地方高校改革发展资金人才培养支持计划项目2项。获省校教学成果奖3项。教师参加省级教学竞赛获奖5项。师生发表SCI、EI、重要核心期刊50余篇，出版教材和著作20余部，其中三部教材获省规划教材。学院建有国家一流课程1门、省级一流课程2门，省级精品课程2门。这些都为人才的高质量培养提供了保障。

学院坚持以人才培养为中心，持续推进质量文化建设，深化教育教学改革。通过校校、校企协同，贯通第一、第二和第三课堂，实现学科交叉融合、产学研融合，提高学生综合素质的养成。五年来，学生在校期间创新能力和专业实践能力大幅提升，学科竞赛国家级奖励58项。富有特色的暑期实践活动的开展，育人效果显著，多次被今日头条、搜狐新闻等各大媒体报道。

目前，学院已培养了9届学科教学（数学）领域教育硕士研究生。数学一级学科已培养6届学术型硕士研究生。学院现有硕士研究生导师19人，专业硕士研究生校外导师17人。研究生培养过程中注重学术交流与合作，逐步形成“勇于探索、乐于分享、善于合作”的科研氛围。五年来，学院共计承办学术会议6次，每年一次研究生学术沙龙，培养的研究生应届攻读博士的共计7人。通过教师为学生做学术报告，教学内容融入学科前沿成果、引导学生参与科研项目，指导学生创新训练等方式实现科研反哺教学，并取得良好育人成效。